Como todos los pueblos, todas las culturas de nuestra civilización ha tenido y tendrá una historia, La Institución Educativa Departamental Las Mercedes, también tiene su historia en los años 1960 un grupo de personas inquietas por el motivo que nuestro pueblo no tenía una Escuela primaria, germinó esta idea de crear una escuela para que sus hijos avanzaran en la básica primaria, más tarde la misma comunidad, tomó la iniciativa para seguir más allá de la Primaria, entre esas personas podemos mencionar al jefe de núcleo 038 Henry Patiño Paba, Abel Rocha Consejo Directivo. Fue así como en el año de 1999, esa idea se plasmó realizada en la Secretaría de Educación Departamental con la resolución # 1188 del 29 de noviembre de 1999 se dio la aprobación a la básica Secundaria, con la ponencia presentada por el Supervisor de la zona Gabriel Cera., Creándose el Centro de Educación Básica Rural Las Mercedes.
Para el año 1998, se inician las labores administrativas y académicas en las mismas infraestructuras físicas.
En el 2000-2002, se gestionan los servicios de nuevos docentes Licenciados para poder abrir el nivel de la Básica secundaria.
En el 2002 del 15 de marzo se realiza la FUSIÓN de la Escuela Rural Mixta Andrés Bello del Coco y la escuela Rural Mixta Ignacio Hadechinny de Pajaral, con decreto No 106, emanada de la Secretaría de Educación Departamental
Su primera promoción en la básica secundaria se da en el año 2002-2006.
Del 2007 hasta la fecha inicio la media técnica agropecuaria.
Durante sus 46 años de existencia (1960 – 2006), la institución ha tenido 4directoras y un rector, quienes a través de sus gestiones ha logrado muchos alcances, de igual manera las administraciones que han contribuido en ello, entre los directores(a) tenemos:
- Cristina Castro
- Petrona Beleño
- Tomasa Dávila
- 977-1979 Regina Morales
- 1980 hasta la fecha Beatriz Tomasa Jiménez